如何处理商标权转让合同中的纠纷问题？商标合同纠纷是指当事人之间就商标的权利归属、转让、许可使用和商标代理等事宜所订立的合同而发生的纠纷。一般包括商标权转让合同纠纷、商标使用许可合同纠纷和商标代理合同纠纷。那么如何处理商标权转让合同中的纠纷问题呢？

商标合同纠纷要提交仲裁机构解决，合同当事人必须在商标合同中订有仲裁条款或在事后达成书面仲裁协议。仲裁裁决具有法律效力。

商标合同纠纷的调解可以分为民间调解、仲裁调解和诉讼调解三种，分别在当事人将合同纠纷提交仲裁或提起诉讼前、合同纠纷由仲裁机构仲裁过程中或合同纠纷由人民法院审理过程中发生。狭义的商标合同纠纷的调解仅指民间调解。民间调解达成的协议不具有法律上的强制执行力，但仲裁调解达成的协议或诉讼调解达成协议在依法制作法律文书生效后具有强制执行力，当事入必须履行协议内容。

商标合同纠纷的调解没有法定舶程序，但商标合同纠纷的仲裁或诉讼则必须严格依照仲裁法和民事诉讼法规定的程序进行，否则属于在程序上的不合法。

商标合同纠纷由仲裁机构仲裁后作出的裁决，一裁终裁，具有法律效力，当事人不自觉履行的，另一方当事人可以向有关人民法院申请强制执行。

商标合同纠纷由人民法院依法审理后，作出民事判决书，当事人可以在法定期限内向上一级法院上诉，实行二审终审。生效的民事裁判具有强制执行力，当事人应当自觉履行，不履行的，法院可以应一方当事人的申请或依职权采取措施，强制当事人履行裁判的内容。