专利被侵权时可以选择起诉的法院有，专利权人在发现侵权人侵犯其专利权后，亦可径自向侵权行为地、被告所在地等相关人民法院提起民事诉讼，要求停止侵权行为赔偿经济损失等。

同时有权申请对侵权人的侵权事实和证据进行诉讼保全，申请法院强制令，禁止侵权人继续侵权行为。为保证经济赔偿的切实执行，专利权人在起诉的同时，可向受理法院申请对侵权人的等额财产进行诉讼保全。

向法院提起诉讼时，选择起诉的法院可以有：

1、专利侵权纠纷案件，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。侵权行为地包括：

（1）被控侵犯发明、实用新型专利权的产品的制造、使用、许诺销售、销售、进口等行为的实施地

（2）专利方法使用行为的实施地，依照该专利方法直接获得的产品的使用、许诺销售、销售、进口等行为的实施地；

（3）外观设计专利产品的制造、销售、进口等行为的实施地；

（4）假冒他人专利的行为实施地；

（5）上述侵权行为的侵权结果发生地。

2、原告仅对侵权产品制造者提起诉讼，未起诉销售者，侵权产品制造地与销售地不一致的，制造地人民法院有管辖权；以制造者与销售者为共同被告起诉的，销售地人民法院有管辖权；销售者是制造者的分支机构，原告在销售地起诉侵权产品制造者制造、销售行为的，销售地人民法院有管辖权。

3、专利权属纠纷案件，由被告住所地人民法院管辖。

4、专利权合同纠纷案件，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。合同当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民法院管辖，但不得违反级别管辖和专属管辖的规定。