现在，做软件著作权代理、商标申请代理需要什么资质吗？比如必须考什么证啊之类的？

如果您不需要资格，则可以去当地的工商局建立一个知识产权公司。

办理专利代理事务所需要资质吗？具体流程是什么？

“专利代理人管理条例”似乎至少需要三份专利律师证书。

目前，在中国的版权代理机构大概有多少

版权代理商不需要特殊的资格，一般的知识产权代理机构（包括商标，专利代理机构）都可以从事这项业务。